Mesta zaklyucheniya
Tyumenskaya o., g.Ishim, tyur'ma 
God nachala 1943 
Mesyats nachala 11 
Omsk, tyur'ma 
Moskva, Vnutrennyaya, Lefortovskaya, Butirskaya, Krasnopresnenskaya tyur'mi 
God okonchaniya 1944 
Mesyats okonchaniya 7 
Sibirskie lagerya 
God nachala 1944 
Mesyats nachala 8 
God okonchaniya 1946 
Mesyats okonchaniya 8 
V lagere rabotal na polevih rabotah, zatem assenizatorom.
Posle prihoda k pravleniyu Patriarha Aleksiya I episkop Afanasij primirilsya
s Moskovskoj Patriarhiej, odnako esche mnogo let ostavalsya v zaklyuchenii. On pisal:
    "Kogda v 1945g., buduchi v zaklyuchenii, ya i bivshie so mnoyu ierei, ne pominavshie
     mitr.Sergiya, uznali ob izbranii i nastolovanii Patriarha Aleksiya, mi,
     obsudivshi sozdavsheesya polozhenie, soglasno reshili, chto tak kak
     krome Patriarha Aleksiya, priznannogo vsemi Vselenskimi Patriarhami, teper'
     net inogo zakonnogo pervoierarha Russkoj Pomestnoj Tserkvi, to nam dolzhno
     na nashih molitvah voznosit' imya Patriarha Aleksiya, kak Patriarha nashego,
     chto ya i delayu neukosnitel'no s togo dnya"